胚胎本身的因素如染色体异常，或者在胚胎发育早期某些重要的组织、器官没有正常发育形成，这种情况属于自然的淘汰，即“适者生存，劣者淘汰”。胚胎停育是指妊娠早期胚胎因某种原因所致发育停止。B超检查表现为妊娠囊内胎芽或胎儿形态不整，无胎心搏动，或表现为妊娠囊枯萎，临床属于流产或死胎的范畴。
胚胎染色体异常的原因
造成胚胎停育的原因很多，但是据国外医学研究证实，因为染色体之间会发生配对、互换和分离形成配子，配子结合形成合子。合子发生异常的，会导致胎儿不能正常发育，出现流产、死胎、死产、畸形儿等等。
停止发育的胚胎绒毛细胞染色体异常可达50-70%，异常的形式多为染色体非整倍体异常，其次为染色体形态结构的异常。故胚胎染色体异常是造成胚胎停育的最大原因。夫妇任何一方有染色体异常可传至子代，染色体异常的胚胎有一半以上要发生早期自然流产。染色体异常包括数量和结构异常，最常见的异常染色体核型为三倍体，如21三体，16三体，13三体和18三体等，大部分胚胎难以存活，发生胚胎停止发育或自然流产。
因此产前诊断是尤为重要的。染色体异常导致的流产、胎停等方法目前没有有效的治疗方法。由于染色体上排列的DNA是人体的遗传因子，因此从理论上来讲，染色体异常一定有分娩正常核型及婴儿遗传的可能，对于这样的夫妻。
针对目前选择做试管婴儿的夫妻建议
在怀孕前一定要做好胚胎筛查，才能确保生育正常的婴儿。数据显示：夫妇双方染色体都正常，但配子形成和胚胎发育过程中也会出现染色体异常。比如女性年龄大于35岁，卵子老化，会发生染色体不分离，导致染色体异常。或者男性染色体正常但精液异常，大头畸形的精子在受精后会形成多倍体胚胎，同样也会导致流产。
胚胎停育的预防
孕前准备：女性朋友应该有适当的准备期，注意饮食均衡、生活规律、锻炼身体以及孕前的检查等等，并积极参加妇婴医院为准妈妈们特别准备的健康课堂，多与医生进行沟通，全方位了解孕前、孕中、产后的各种孕期知识。
适时检查：一般胚胎8周左右有胎心，胎停育现象在8-12周就有可能出现，所以建议孕妇8周左右最适宜去做B超，以便及早检查胎儿和胎盘的发育情况。如果出现了胎心，大致可以放心。
流产处理：当孕妈妈不幸被确诊为胎停育后，也不要恐慌，通常需要在医生的指导下做流产处理。胎停育不同于早早孕，采用药流不容易完全排净，如果长期残余在子宫里，会引发宫内感染，损伤子宫内膜，继而引发输卵管闭塞，导致不孕。不建议使用无痛人流，因为无痛手术患者失去知觉，刮穿子宫了也不知道。
胎停检查：胎停育后必须检查男女原因，切勿把希望完全寄托在保胎身上。假如是胚胎质量问题，保胎是无法改变胚胎质量的。
针对已经怀孕的染色体异常孕妇
不同类型染色体发育不全预后不尽相同，多数预后不良智力低下和生长发育迟滞是染色体病的共同特征。染色体发育不全治疗困难疗效不满意预防显得更为重要预防措施包括推行遗传咨询、染色体检测、产前诊断和选择性人工流产等，防止患儿出生。孕妇应该定期做产前检查，如果胎儿有问题，至少能及早发现。抽羊水诊断是能检验胎儿是否患有先天染色体缺陷的其中一个方法。
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