益生菌可缓解因大量使用抗生素而导致的伪膜性肠炎，临床副作用和复发率均明显降低。益生菌还可以同时治疗腹泻和便秘。

益生菌在肠道上皮细胞附着及形成屏壁作用，维持肠道益生菌群的平衡，预防和治疗腹泻。

人体肠道的有害菌如大肠杆菌、变形杆菌等产生的内毒素经静脉进入血液中，对于肝脏会产生很严重的损伤。

益生菌等有益菌可以影响胆固醇的代谢，将其转化为人体不吸收的类固醇，降低血液中胆固醇的浓度，对高血压和动脉硬化有很好的防治作用。

益生菌中的双歧杆菌和嗜酸乳杆菌能分解蛋白质，使其变成小分子的肽及氨基酸等，易于消化吸收，改变过敏蛋白质的抗原性，以及降低过敏反应的。

益生菌发酵乳糖产生半乳糖，是构成脑神经系统中脑苷脂的成分，与婴儿出生后脑的迅速生长有密切关系。益生菌可以产生维生素B1、B2、B6、B12及丙氨酸、缬氨酸、天冬氨酸和苏氨酸等人体必需的营养物质，对于人体具有重要营养作用。

目前已被国内外生物学家所证实，肠内乳酸菌与健康长寿有着非常密切的直接关系。人体肠道内乳酸菌拥有的数量，随着人的年龄增长会逐渐减少，当人到老年或生病时，乳酸菌数量可能下降到1/100～1/1000，直到临终时完全消失。在平时，健康人比病人多50倍，长寿老人比普通老人多60倍。欧美和日本的微生态学家调查表明，长寿老人粪便中的益生菌数量与中、青年相当。

益生菌能改变厌食、挑食、食欲不振的习惯，促进食物营养成分的吸收。益生菌在人体肠内发酵后可产生乳酸和醋酸，能提高钙、磷、铁的利用率，促进铁和维生素D的吸收，促进营养作用。双歧杆菌和嗜酸乳杆菌等乳酸菌能分解乳糖，产生半乳糖。半乳糖有助于儿童脑及神经系统的发育。乳酸菌代谢产生的乳酸，可提高胃内食物的预消化，促进胃内容物的排出，增进消化；产生的酵素可促进食物营养的分解，提高人体吸收率。

益生菌具有降解N-亚硝酸、消除氧自由基、过氧化脂质的作用。嗜酸乳杆菌能增加先天性免疫反应。

双歧杆菌和嗜酸乳杆菌将糖分解后生成乳酸和醋酸，能有效维护阴道的PH值环境，能有效抑制披衣菌、淋病双球菌、链球菌、链珠菌等真菌，有效治疗霉菌性阴道炎，目前被各大临床医院广泛应用。

益生菌缓解各种疾病，增强人体健康的作用机制，，合理补充是完全没有任何副作用的。